紫外线消毒器的杀菌原理是利用紫外线的杀菌能力，那么紫外线可以直接杀死微生物吗？
根据生物效应的不同，一般将紫外线按照波长划分为四个部分：A 波段(UV－A)，又称为黑斑效应紫外线(400～320 nm)；B 波段(UV－B)，又称为红斑效应紫外线(320～275 nm)；C 波段(UV－C)，又称为灭菌紫外线(275～200 nm)；D 波段(UV－D)，又称为真空紫外线(200～100 nm)。水消毒主要采用的是C 波段紫外线。
微生物在紫外光的照射下发生光化反应破坏微生物的核酸使其失去活性。细胞的 DNA 和 RNA 吸收短波 UV 发射的高能量，吸收波长大部分在 200～275 nm 范围内的 UV 能量，这将导致在临近的核苷之间形成新的结合物，在核酸内创造了双结构或二聚物。DNA 中的胸腺嘧啶经过光化学的破坏，相邻的嘧啶产生二聚作用。细菌和病毒菌素的 DNA 中多数胸腺嘧啶二聚物的形成阻止了复制和zui终导致细胞死亡。因此，紫外线并不能直接杀死微生物，而是通过阻止微生物细胞的复制，zui终导致其死亡。